给AI装个科研工具包,一句话干完一天的活
2026年1月18日
查化合物要登ChEMBL,分析结构用RDKit,翻文献上PubMed,处理单细胞数据用Scanpy——做科研时这些工具要一个个打开,每个都要查文档、调参数。
现在有个开源项目把140个常用工具打包好,装进AI里。装完之后效果是:你说"帮我找EGFR抑制剂,分析结构特点",它自动去ChEMBL查数据、用RDKit算性质、搜PubMed找文献,生成报告。
这个项目叫Claude Scientific Skills,专门给Claude这个AI用的。覆盖28个数据库、55个Python包、30多个辅助工具。
实际用起来什么感觉
有组病人的基因检测数据,VCF格式。以前要解析文件、去Ensembl注释、查ClinVar看致病性、上COSMIC找突变、搜PubMed找病例,每个数据库单独操作,快也要两三小时。
现在上传文件,说一句:"分析遗传变异,看癌症相关基因,给临床解读。"十几分钟出结果,每个突变都标好了功能、致病性、参考文献。
单细胞测序分析也一样。传统流程要用Scanpy加载数据、质控、标注细胞、跑差异表达、做通路富集,每步写代码调参数,新手要学几周,熟手也得一两天。
现在:"用Scanpy分析这组10X数据,标注细胞类型,找差异基因,做通路富集,看有没有治疗靶点。"它自动完成整个流程。
药物虚拟筛选更明显。以前要去ZINC筛化合物、下载数据、用RDKit过滤、找蛋白结构、配置对接软件、跑计算、查供应商,一两天工作量。
现在:"去ZINC找分子量300-500、logP在2-4的小分子,用RDKit过滤,跟AlphaFold的EGFR蛋白做对接,看哪里能买。"几十分钟出结果。
关键是完全不需要懂工具怎么用。说清楚想做什么,它知道该调哪个数据库、怎么处理、怎么传给下一步。
怎么装
先装Claude Code(Anthropic出的命令行工具):
Mac/Linux:
curl -fsSL https://claude.ai/install.sh | bash
Windows:
irm https://claude.ai/install.ps1 | iex
装好后输入:
/plugin marketplace add K-Dense-AI/claude-scientific-skills
按提示点几下就行。
之后直接说任务。比如"设计实验验证TP53在细胞凋亡里的作用",它会查蛋白功能、找互作网络、搜文献、设计步骤、列试剂,甚至生成自动化液体处理协议。
"写篇CRISPR基因编辑最新进展的综述",它去搜文献、提取信息、按学术规范写成文、管理引用。你最后润色就行。
用Cursor这类编辑器一键装。想在其他AI工具上用,可以连MCP服务器:https://mcp.k-dense.ai/claude-scientific-skills/mcp
项目MIT开源,免费用。工具把重复劳动自动化了,你把时间花在真正需要思考的地方。
项目地址: github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills
系统要求: Python 3.9+ / uv / Claude Code
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